Jacobus Kamarlo Mayongpadang yang biasa dipanggil Kobu memiliki pengalaman dalam berorganisasi dan juga menjadi pengurus di dalamnya. Organisasi-organisasi tersebut diantaranya Persatuan Pemuda Gereja Toraja (PPGT), Gerakan Mahasiswa Kristen Indonesia (GMKI), Persatuan Wartawan Indonesia (PWI), Serikat Buruh Seluruh Indonesia (SBSI) dan juga Serikat Mahasiswa Fisipol Universitas Hasanudin. Kobu juga pernah menggeluti dunia jurnalistik dengan menjadi wartawan pada harian Pedoman Rakyat dan harian Suara Pembaharuan. Di dalam dunia Politik, Kobu mewakili Fraksi PDIP duduk dalam DPRD Kota Makassar sebagai anggota dan juga di DPRD RI sebagai anggota pada tahun 1999-2004. Di periode selanjutnya Kobu menjabat Wakil Sekjen PDIP dan juga Sekretaris Fraksi PDIP. Pada Pemilihan Umum 2009-2014 Kobu berhasil duduk di kursi legislatif DPR RI Komisi IV sebagai anggota. Tahun 2005 karena dirinya kecewa akan ketidak tegasan DPR dalam menolak kenaikan harga BBM, Sekretaris Fraksi PDIP Jacobus Kamarlo Mayongpadang melakukan aksi mogok makan di press room Gedung Nusantara III, Gedung DPR/MPR. Jacobus Kamarlo Mayongpadang yang saat itu juga menjabat Wakil Sekjen PDIP nampak mengenakan masker karena flu yang dideritanya. Pada 5 tahun terakhir Kobu yang juga menderita gastritis pun terpaksa harus dilarikan ke RS tanggal 22 Maret 2005 pukul 12.00. Di tahun yang sama Jacobus Kamarlo Mayongpadang dan anggota Fraksi partai yang lain tidak menggunakan uang rapelan dana operasional sebanyak Rp 50 juta dengan mengembalikan uang tersebut ke kas negara, sedang anggota Fraksi Partai yang lain menyumbangkan kepada korban tsunami dan menyumbangkannya ke koperasi untuk selanjutnya dipinjamkan sebagai permodalan usaha mikro. Pada saat sedang ramai kasus flu burung di tahun 2008 yang banyak merenggut korban jiwa bukan hanya hewan ternak tetapi juga manusia, Jacobus selaku anggota Komisi IV DPR menjadi anggota Pansus Rancangan Undang-Undang tentang Peternakan dan Kesehatan Hewan, RUU ini sendiri telah mengendap di DPR selama 13 tahun. Tahun 2009, Yacobus Kamarlo Mayongpadang ikut dalam pemilihan Caleg DPR RI dengan nomor urut 1 daerah pilihan Sulawesi Selatan II, dengan perolehan suara sebesar 35.498 suara Kobu pun lolos dan berhasil duduk di kursi anggota DPR RI Komisi IV Fraksi PDIP untuk periode 2009 – 2014. Pada tahun 2011 dalam Pemilihan Gubernur dan Wakil Gubernur Sulawesi Barat, Jacobus Kamarlo Mayongpadang dipasang Dewan Pimpinan Daerah (DPD) Partai Demokrasi Indonesia Perjuangan (PDIP) Sulbar sebagai salah satu dari tiga bakal calon gubernur Sulbar 2011 (cagub) dan dua calon wakil gubernur (cawagub).