Pada tahun 1999 hingga 2004 Erman menjabat sebagai anggota DPR, dan di lanjutkan pada periode 2004 sampai 2009, Wakil Ketua Komisi V DPR 2004 hingga 2005, bendahara umum PKB yang kemudian di angkat menjadi Ketua Fraksi Partai Kebangkitan Bangsa DPR RI pada tahun 2005. Erman pernah mengalami kecelakaan saat melakukan perjalanan dengan menggunakan bus pada 13 Desember 2004. Bus tersebut masuk jurang di Bantul, Yogyakarta dan Erman adalah salah seorang penumpang yang mengalami luka-luka. Erman Suparno, dipercaya menjabat Menteri Tenaga Kerja dan Transmigrasi untuk periode 2005 hingga 2009, dia dilantik menjadi menteri pada Rabu 7 Desember 2005. Yang sebelumnya di jabat oleh Fahmi Idris.